La Policía Nacional Civil (PNC) informó que el individuo, de 44 años, fue arrestado cuando regresaba a Guatemala desde Colombia con un pasaporte a nombre de Juan Alberto Donis Prado.
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Amézquita fue presentado ante el Juzgado de Turno para que conozca el motivo de su detención.
Las autoridades no precisaron detalles sobre la banda que Amézquita lidera.
En 2012, el sujeto fue incluido entre los 30 más buscados por la Agencia de Servicios Fronterizos de Canadá, que declara inadmisibles en su territorio a personas acusadas de crímenes, delitos contra la humanidad y ser miembros de organizaciones delictivas.
También fue señalado en los casos Gerardi y vinculado a la banda de secuestradores Valle del Sol en los 90.