La incautación se produjo luego de que los tripulantes del buque fueron observados desde un avión del Servicio de Vigilancia Aérea cuando recogían unos bultos flotando en el mar, indicó el ministerio en un comunicado.
Los guardacostas, notificados de la presencia del barco, interceptaron la nave y encontraron 18 bultos y 29 paquetes sueltos de droga, con un cargamento total de 1 mil 387 libras de cocaína.
Inicialmente no se reveló el origen ni el destino que tendrían los estupefacientes.
Las autoridades costarricenses han detenido en lo que va de este año 16 barcos con drogas en el Caribe y el Pacífico. En total se han decomisado más de 13 toneladas de cocaína en los primeros nueve meses del 2015, según el ministerio.